mRNA 配列最適化
✓ 已验证RNALens · Spearman 0.92 · CAI 0.7->0.95 · 自研微調整モデル
mRNA ワクチン配列設計は単に「アミノ酸を塩基に翻訳する」ことではない。コドン使用頻度が翻訳効率に影響し、UTR 構造が安定性と積載効率に影響する。DiVo Gen²AI は自研 RNALens 微調整モデルでリボソーム積載効率を予測--第三者 API の呼び出しではなく、56万行の自研コードの一部。本ページは3つの読者向け:mRNA 最適化を理解したい患者と公衆、配列最適化パートナーを探すワクチン/CAR-T チーム、技術力を評価する投資家と同行。
下の「mRNA 配列最適化とは」をお読みください--ワクチン設計が単なる塩基翻訳でない理由を理解。
「DiVoの役割」「4ステップパイプライン」「検証指標」を重点に--自研微調整は API ラッパーではない。
「差別化」「検証指標」「用語集」を重点--自研微調整モデルの技術障壁を評価。
mRNA 配列最適化は以下の旗艦サービスの重要ステップ
mRNA 配列最適化とは
mRNA ワクチンの核心はメッセンジャー RNA 配列であり、人体細胞に送り込まれた後、細胞に標的タンパク質(腫瘍抗原など)の合成を指示し、免疫応答を引き起こす。しかし同じアミノ酸でも複数の異なるコドンでコードでき、コドン使用頻度の差は大きい。
mRNA 配列最適化はアミノ酸配列を塩基に翻訳する単純な作業ではなく、同じタンパク質をコードできる全候補配列の中から、翻訳効率が最も高く安定性が最も良いものを選ぶこと。コドン選択は翻訳速度(CAI)に影響し、UTR 構造は mRNA 半減期とリボソーム積載(MRL)に影響し、異なる標的組織ではコドン偏好が異なる。
DiVo は自研 RNALens 微調整モデルでリボソーム積載効率を予測(Spearman=0.92)、第三者 API の呼び出しではなく--微調整データ、訓練フロー、推論サービスは全て自デプロイ。
同じアミノ酸には2-6個のコドンがある。人体細胞は特定のコドンを他よりはるかに速く翻訳する--正しいコドンを選ぶことで翻訳効率を0.7から0.95に向上できる(CAI 指数)。
汎用事前訓練モデルの mRNA 配列予測精度は限定的。三段階微調整で RNALens を mRNA MRL タスクに特化--Spearman=0.92 は汎用モデルのゼロショット性能ではなく、ドメイン適応後の専精結果。
DiVo Gen²AI の役割
mRNA 配列最適化は DiVo 新生抗原8ステップパイプラインのStep 7であり、CAR-T 5ステップパイプラインの CAR 構築体 mRNA 最適化の核心能力でもある。コドン最適化からリボソーム積載予測まで UTR 最適化までの全鎖路を提供--CAI 最適化だけで結果を出すのではなく、コード領域と調控領域を同時に最適化し、自研モデルで機能検証。
mRNA デリバリーシステム設計(LNP 処方など)はしない、in vivo 発現効率の実験検証はしない。計算最適化された mRNA 配列設計方案を納品する。
コア能力 · 4ステップパイプライン
アミノ酸配列から組織適応の最適 mRNA 配列まで
コドン最適化 (CAI)
✓ 已验证自研コドン最適化アルゴリズム
CAI 0.7 -> 0.95 最適化配列
リボソーム積載効率予測
✓ 已验证RNALens (DNABERT-Z 117M 微調整)
MRL 予測 + Spearman=0.92
UTR 最適化 + 安定性評価
✓ 已验证GEMORNA + ViennaRNA
5'/3' UTR 最適化配列 + 二次構造スコア
組織適応モデル選択
✓ 已验证HEK293T / Muscle / PC3
標的組織適応の最適配列
差別化優勢
「CAI のみ」と「第三者 API 呼び出し」との核心的区別
自研微調整、第三者 API ではない
RNALens は DNABERT-Z 117M パラメータ三段階微調整に基づく。微調整データ、訓練フロー、推論サービスは全て自デプロイ。第三者モデル API のラッパーではなく、56万行の自研コードの一部。
コード領域だけでなく調控領域も最適化
多くの mRNA 最適化サービスは CDS コドン最適化のみ。DiVo は GEMORNA で UTR を生成 + ViennaRNA で安定性を評価し、コード領域と調控領域を同時に最適化--翻訳効率と安定性の両方を兼顾。
コア能力
CAI コドン適応指数最適化
✓ 已验证0.7から0.95へ向上--コドン使用頻度を宿主細胞偏好に寄せ、翻訳効率を大幅に向上。
MRL リボソーム積載効率予測
✓ 已验证DNABERT-Z 117M パラメータ三段階微調整の RNALens モデル。Spearman=0.92, R²=0.87--mRNA 配列のリボソーム積載効率を予測。
5'/3' UTR 最適化
✓ 已验证GEMORNA 生成 + ViennaRNA 安定性評価。コード領域だけでなく調控領域も最適化。
3 組織適応モデル
✓ 已验证HEK293T / Muscle / PC3 三種の標的組織/細胞系適応モデル--異なる組織は異なるコドンを偏好。
なぜ「自研微調整」を強調するか
第三者 API の呼び出しではない
RNALens は DNABERT-Z 117M パラメータ三段階微調整に基づく自研モデル。微調整データ、訓練フロー、推論サービスは全て自デプロイ。
汎用事前訓練ウェイトではない
三段階微調整:(1) DNABERT-Z 117M 事前訓練 -> (2) mRNA MRL 下流タスク微調整 -> (3) DiVo 自研データドメイン適応微調整。
実戦検証あり
アスパラギナーゼプロジェクト:6194 変異 × 11版迭代。CAI 0.7->0.95。玩具プロジェクトではない。
検証指標
| 指標 | 値 | 説明 |
|---|---|---|
| MRL Spearman | 0.92 | リボソーム積載効率予測相関 |
| R² | 0.87 | 決定係数 |
| CAI 最適化後 | 0.95 | 0.7から向上 |
| DNABERT-Z パラメータ | 117M | 三段階微調整 |
| 組織適応モデル | 3種 | HEK293T / Muscle / PC3 |
| 実戦検証 | アスパラギナーゼ 6194 変異 | 11版迭代 |
誠実な境界
できることとできないこと、すべて明記
できること
明確にしないこと
用語集
mRNA 配列最適化分野の核心5用語
| 略称 | フルネーム | 訳語 | 解説 |
|---|---|---|---|
| CAI | Codon Adaptation Index | コドン適応指数 | コドン使用頻度と宿主細胞偏好の一致度を測定、高いほど翻訳効率が良い |
| MRL | Mean Ribosome Loading | 平均リボソーム積載 | mRNA 上のリボソーム平均数、翻訳開始効率を反映 |
| UTR | Untranslated Region | 非翻訳領域 | mRNA 両端のタンパク質をコードしない調控配列、5' UTR は翻訳開始に、3' UTR は安定性に影響 |
| RNALens | DiVo RNALens | DiVo RNA 予測モデル | DNABERT-Z 117M 三段階微調整に基づく自研 mRNA 性質予測モデル |
| GEMORNA | Generative mRNA | mRNA 生成モデル | mRNA UTR 配列の生成と最適化に用いる生成モデル |
CAPACITY TRACE
能力回溯
这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
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