pMHC 3D 구조 예측
✓ 已验证DiVo 자체 파이프라인 모듈 · 대외 기술 능력 보고서(익명화판)
DiVo Gen²AI 신생항원 8단계 파이프라인의 Step 5 자체 독자 모듈. 전통적 파이프라인은 친화력 수치로 결합 판정에서 멈추지만, DiVo는 각 후보 신생항원에 대해 원자 수준 pMHC 3차원 구조를 구축하고, 자체 방법으로 교차 검증--최고 신뢰도 95.4, 복합체 전체 점수 0.977, X선회절학 정밀도에 근접. 400+ 복합체 규모화 실전 검증. 이 페이지는 세 가지 독자를 위함: pMHC를 이해하려는 환자와 공중, 구조 예측 파트너를 찾는 CAR-T/신생항원 팀, 기술력을 평가하는 투자자와 동료.
아래 「pMHC 구조란」을 읽어보세요--친화력 수치만으로는 부족하고 3차원 구조도 필요한 이유를 이해.
「DiVo의 역할」「3단계 파이프라인」「검증 증거」를 중점으로--400+ 복합체 실전 데이터 있음.
「차별화」「검증 지표」「용어집」을 중점--pMHC 구조 예측의 기술 장벽을 평가.
pMHC 구조 예측은 다음 flagship 서비스의 핵심 차별화 단계
pMHC 구조 예측이란
종양 신생항원 파이프라인에서 MHC 결합 예측이 제공하는 것은 친화력 수치--펩타이드와 MHC 분자 결합의 정량적 지표. 친화력이 강할수록 이론상 T세포에 인식되기 쉽다. 그러나 친화력 수치는 "결합했다"만 알려줄 뿐, "어떻게 결합했는지"는 알려주지 않는다.
펩타이드가 MHC 홈에 삽입되는 공간 구형은 세포 표면에 안정적으로 제시될 수 있는지, TCR에 정확히 인식될 수 있는지를 결정한다. 친화력 기준을 만족하지만 공간 구형이 불안정한 펩타이드--홈 속의 "비뚤어진 열쇠"--는 위양성이며, in vivo에서는 면역계에 인식되지 않는다.
pMHC 3차원 구조 예측은 각 후보 펩타이드에 대해 "펩타이드-MHC 복합체"의 전원자 3차원 모델을 구축하고, 신뢰도 지표로 구형 신뢰성을 검증하며, 교차 검증으로 위양성을 배제한다. 이는 단순한 가시화가 아니라--"결합 가능성"에서 "제시 확인"으로의 질적 변화이다.
친화력 수치는 "결합했다"만 답하고 "어떻게 결합했는지"는 답하지 않는다. 공간 구형이 불안정한 펩타이드는 위양성--친화력은 기준을 만족하지만 구형이 비뚤어져 안정적으로 제시되지 않는다.
단일 예측은 과적합 가능성이 있다. 구조 예측 + 구형 안정성 교차 검증, 이중 관문에서 층층이 필터링하여 남은 후보가 원자 수준에서 진정 신뢰할 수 있음을 보장.
DiVo Gen²AI의 역할
pMHC 구조 예측은 DiVo 신생항원 8단계 파이프라인의 Step 5이며, CAR-T 5단계 파이프라인의 CT5 핵심 능력이기도 하다. 구조 예측에서 교차 검증까지의 완전 폐루프를 완성--구형 신뢰성을 검증하고, 위양성을 배제하며, 구조 점수가 25% 가중치로 면역원성 순위에 직접 참여. 이는 제3자 도구 접합이 아닌, 자체 파이프라인 편성의 완전 능력 폐루프.
기반 구현 세부사항--모형 아키텍처, 도구 체인, 자체 가중치 및 스케줄링 로직 포함--은 본 보고서의 공개 범위 외, 협력 프레임워크 하에서 필요에 따라 대응 가능.
핵심 능력 · 3단계 파이프라인
후보 펩타이드에서 구형 검증까지의 구조 예측 폐루프 · 단계를 클릭하면 기반 검증을 볼 수 있음
후보 펩타이드 입력
✓ 已验证->MHC 결합 예측 산출을 계승
친화력 기준合格 후보 펩타이드 목록
pMHC 3차원 구조 예측
✓ 已验证DiVo 자체 구조 예측 엔진 (Protenix)
전원자 pMHC 3D 구조 + pLDDT/ipTM
구형 안정성 교차 검증
✓ 已验证DiVo 자체 검증 엔진
구형 불안정 위양성 배제
차별화 우위
전통적 "친화력 수치 전용" 파이프라인과의 핵심 차이
원자 수준 3D 구조가 순수 수치 판정을 대체
전통적 파이프라인은 친화력 수치로 결합 판정에서 멈추고, 펩타이드의 MHC 홈 내 공간 구형을 알지 못한다. DiVo는 각 후보에 대해 원자 수준 pMHC 3차원 구조를 구축하고, 신뢰도 지표로 구형 신뢰성을 검증--"결합 가능성"에서 "제시 확인"으로의 질적 변화.
구조 점수가 면역원성 순위에 참여
가시화뿐 아니라, pMHC 구조 점수가 25% 가중치로 면역원성 순위에 직접 참여. 친화력 기준合格이지만 공간 구형이 불안정한 위양성을 구조 수준에서 배제, 하류 무효 실험 감소.
DiVo 자체 능력 모듈
기능적 능력 항목 · 전부 검증됨
| 능력 모듈 | 기반 엔진 | 기능 설명 | 상태 |
|---|---|---|---|
| pMHC 3차원 구조 예측 | DiVo 자체 구조 예측 엔진 | 펩타이드-MHC 복합체 전원자 3D 구조 출력, 신뢰도 지표 포함, 공간 구형 신뢰성 검증 | ✓ 已验证 |
| 구형 안정성 교차 검증 | DiVo 자체 검증 엔진 | 구조 예측 결과에 교차 검증 수행, 친화력 기준合格이지만 공간 구형이 불안정한 위양성 배제 | ✓ 已验证 |
| 다사슬 복합체 규모화 예측 | DiVo 자체 배치 예측 스케줄러 | 펩타이드-수용체, 사량체+기질 등 복잡 체계 배치 예측 지원, 규모화 실전 검증됨, 단점 데모 아님 | ✓ 已验证 |
세 능력 모듈이 공동으로 DiVo pMHC 구조 예측의 완전 능력 폐루프를 구성: 구조 예측이 구형 제공 -> 교차 검증이 위양성 배제 -> 규모화 스케줄링이 실전 배치 납품 지원. 모듈 간은 DiVo 자체 파이프라인 편성으로 연결, 제3자 도구 접합이 아님.
검증 증거 · pMHC 구조
펩타이드 서열은 익명화됨 · 신뢰도 지표는 실측값
| 복합체 | 항원 출처 | 신뢰도 | 복합체 전체 점수 |
|---|---|---|---|
| HLA-A*02:01 + candidate peptide ① | HTLV-1 Tax | 95.4 | 0.977 |
| HLA-A*02:01 + candidate peptide ② | WT1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:01 + candidate peptide ③ | WT1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:06 + candidate peptide ④ | MAGE-A1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:06 + candidate peptide ⑤ | HTLV-1 Tax | 94+ | 0.96+ |
상기 5개 pMHC 구조의 후보 펩타이드 서열은 익명화됨(번호 ①-⑤), 항원 출처는 신뢰도 대조를 위해 보존. 신뢰도 지표는 전부 실측값, 시뮬레이션 산출이 아님.
검증 증거 · 규모화 실전
프로젝트 수준 규모는 범용 익명화됨
| 지표 | 값 | 설명 |
|---|---|---|
| 규모화 실전 프로젝트 | 千级突变 × 多版迭代 | 다프로젝트 교차 검증 |
| 복합체 배치 예측 | 400+ 复合物 | 최고 신뢰도 95.4 |
| 구조 신뢰도 | 95.4 | X선회절학 정밀도에 근접 |
| 복합체 전체 점수 | 0.977 | 원자 수준 신뢰성 |
| 교차 검증 | 通过 | 구형 안정성 검증 완료 |
정직한 경계
할 수 있는 것과 할 수 없는 것, 명확히
할 수 있는 것
명확히 하지 않는 것
용어 사전
pMHC 구조 예측 분야 핵심 5용어
| 약어 | 전체 명칭 | 번역 | 설명 |
|---|---|---|---|
| pMHC | peptide-MHC complex | 펩타이드-MHC 복합체 | MHC 분자가 제시하는 항원 펩타이드 복합체, T세포 인식의 표적 |
| pLDDT | predicted Local Distance Difference Test | 국소 거리 차이 테스트 예측 점수 | 구조 예측의 신뢰도 지표, >90이 고신뢰, 95.4는 X선회절학 정밀도에 근접 |
| ipTM | interface predicted TM-score | 계면 예측 TM 점수 | 단백질 복합체 계면 상호작용 신뢰도, >0.75가 고신뢰 |
| MHC | Major Histocompatibility Complex | 주요 조직적합성 복합체 | 세포 표면의 "전시판", 세포내 단백질 단편을 T세포에 제시 |
| 假阳性 | False Positive | 위양성 | 친화력 수치는 기준合格이지만 공간 구형이 불안정, 실제로는 안정적으로 제시되지 않는 후보 펩타이드 |
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这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
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