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CT
CAR-T細胞治療計算
デュアルチャネルターゲット発見 + de novo Binder設計 + pMHC 3D構造検証
5ステップドライコンピューティングパイプライン--HLAタイピング + 変異検出からCAR Binder de novo設計 + 構造検証まで。従来のscFvの限界を突破、AIでタンパク質Binderをゼロから設計、2024 Nature BMEでこのルートが検証済み。
3-5週20-80万/プロジェクト能力カバレッジ 85%
パイプラインフロー
エンドツーエンドのドライコンピューティングループ
1
CT1 HLAタイピング + 変異検出
OptiType + Polysolverデュアルツール4桁HLA-Iタイピング + GATK Mutect2体細胞変異 + VEP/ANNOVAR注釈
2
CT2新規抗原スクリーニング + 表面抗原マイニング
MHCflurry(14,883 alleles)新規抗原スクリーニング + pVACseq + Salmon/DESeq2差異発現マイニングで腫瘍特異的膜タンパク質を発掘
3
CT3免疫原性全次元評価
5次元スコアリング(親和力30%+提示20%+加工10%+免疫原性15%+構造25%) + DeepTCR認識実現性
4
CT4 CAR Binder de novo設計
PXDesign + RFdiffusion + ProteinMPNN de novoタンパク質Binder候補配列設計
5
CT5構造検証 + スコアリング
Protenix(pLDDT/ipTM) + Protenix-Dock + PXMeter原子レベル複合体構造 + ドッキングスコア
コアツール
OptiTypePolysolverGATK Mutect2VEPANNOVARMHCflurrypVACseqSalmonDESeq2RFdiffusionProteinMPNNPXDesignProtenixProtenix-DockPXMeter
コア優位性
デュアルチャネルターゲット発見
VCF新規抗原スクリーニング + RNA-seq差異発現デュアルチャネル交叉検証、単一チャネルの限界を突破
de novo Binder設計
RFdiffusion + ProteinMPNN de novoタンパク質Binder設計、scFv親和力・安定性ボトルネックを突破
pMHC 3D構造検証
Protenix原子レベル構造検証（pLDDT=95.4, ipTM=0.977）、偽陽性を削減
能力カバレッジ
85%CROSS-LAYER
このサービスが依存する下層能力
USER SCENE
この技術が患者にどう役立つか
B2B2C：病院/医師を通じて、このパイプラインはこれらのC端シナリオに到達