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Protein Structure Prediction Agent

In Dev结构生物学
蛋白质预测ESMFoldAlphaFold2Agent

蛋白质结构预测 Agent

对话式提交蛋白质序列,Agent 自动调用 ESMFold/AlphaFold2 多模型预测,交叉验证 pLDDT 置信度,输出结构文件与质量报告。

功能特性

  • 多模型交叉验证:同时调用 ESMFold 和 AlphaFold2,对比预测结果
  • pLDDT 置信度评估:自动标注每个残基的置信度,高亮低置信区域
  • 结构文件输出:PDB 格式结构文件 + 交互式 3D 可视化
  • 质量报告:包含 Ramachandran 图、 clashes 检测、序列覆盖率

使用方式

  1. 在对话框中粘贴或上传蛋白质 FASTA 序列
  2. Agent 自动识别序列类型(单体/多聚体/抗体)
  3. 选择预测策略(快速/高精度)
  4. 等待预测完成后查看结果与解读

技术架构

用户输入 → 对话引擎(意图识别) → 编排器(任务拆解)
  → ESMFold Agent(快速预测)
  → AlphaFold2 Agent(高精度预测)
  → 结果聚合 → 交叉验证 → 输出解读

注意事项

  • 单条序列预测约需 2-5 分钟
  • 多聚体预测时间可能更长
  • 预测结果仅供参考,实验验证为金标准