Service Général

Rapport d'Interprétation du Génome

已验证

Bilingue · Pipeline 10 étapes · Toutes vérifiées et livrées

Contrôle qualité VCF -> ANNOVAR 122 colonnes annotation -> FM tri-modèle prédiction pathogénicité -> ClinVar+dbNSFP classification ACMG -> PharmGKB pharmacogénomique -> PRS risque polygénique -> variants mitochondriaux -> NCCN évaluation risque cancer -> ACMG dépistage porteurs -> rapport bilingue. Toutes les 10 étapes vérifiées et livrées. Cette page sert trois audiences : patients et public souhaitant comprendre les rapports génomiques, hôpitaux et pharma cherchant des partenaires d'interprétation, investisseurs et pairs évaluant les capacités techniques.

Patients & Public

Lisez « Qu'est-ce qu'un Rapport Génomique » et « Aux Patients » ci-dessous--vous avez le droit de comprendre votre génome.

Partenaires / Hôpitaux

Focus sur « Rôle de DiVo », « Pipeline 6 étapes », « Benchmarks »--toutes les 10 étapes vérifiées, avec rapports d'échantillon.

Investisseurs / Pairs

Focus sur « Différenciation », « Benchmarks », « Glossaire »--évaluez la barrière technique de la validation croisée FM tri-modèle.

Aux Patients et Familles

Le service d'interprétation du génome de DiVo Gen²AI est une activité qui travaille en coordination avec les établissements médicaux, pas un service directement destiné aux utilisateurs individuels et aux patients. Le rapport d'interprétation du génome est pour référence uniquement et ne remplace pas l'avis médical. En cas de préoccupations de santé, consultez votre médecin traitant ou un conseiller en génétique.

Le rapport d'interprétation du génome fournit la stratification du risque génomique des patients pour les services phares suivants

Qu'est-ce qu'un Rapport d'Interprétation du Génome

Le génome de chacun contient des milliards de paires de bases avec des millions de variants--la plupart sont inoffensifs, quelques-uns peuvent causer des maladies. Un rapport d'interprétation du génome part des données de séquençage brutes (fichier VCF), filtrant, annotant et classant couche par couche, pour finalement vous dire quels locus géniques ont des résultats cliniquement significatifs.

Un rapport d'interprétation complet ne se contente pas de lister « quelle position a changé »--il répond à « ce que ce variant signifie »--pathogène ou bénin ? Quel métabolisme médicamenteux affecte-t-il ? Quel est le score de risque polygénique ? Quelles mutations de maladies génétiques sont portées ? Le rapport de DiVo utilise trois versions pour différents lecteurs : une version en langage simple en chinois pour les ordinary personnes, une version professionnelle en anglais pour les médecins, et une annexe technique pour les pairs bioinformaticiens.

DiVo utilise trois modèles de fondation génomiques pour un vote croisé afin de déterminer la pathogénicité--AlphaGenome (DeepMind), Genos (BGI), Evo2 (Arc Institute)--consensus 2/3 détermine le résultat, pas un seul modèle.

Pourquoi Validation Croisée Tri-Modèle

Un seul modèle de fondation peut mal juger en raison de biais dans les données d'entraînement. Trois modèles de principes différents votent en croisé, consensus 2/3 requis--couvrant différentes populations et méthodes de modélisation, fiabilité plus élevée.

Pourquoi une Version en Langage Simple

Si un rapport génomique n'a qu'une version professionnelle en anglais, les ordinary personnes ne peuvent pas le comprendre. La version en langage simple en chinois vous dit directement ce que les résultats signifient et ce qu'il faut faire--vous avez le droit de connaître votre génome.

Le Rôle de DiVo Gen²AI

Le rapport d'interprétation du génome est la production principale de la dimension L1 Code Source du service Quatre-en-Un de DiVo, et l'entrée pour la stratification du risque génomique des patients dans le pipeline néoantigène et le pipeline CAR-T. Nous fournissons le calcul de bout en bout du VCF aux rapports trifromats--contrôle qualité, annotation, prédiction FM tri-modèle, classification ACMG, pharmacogénomique, PRS, mitochondrial, risque de cancer, dépistage des porteurs, génération de rapports, toutes les 10 étapes vérifiées et livrées.

Nous ne faisons pas de diagnostic clinique (le rapport est pour référence uniquement), ne faisons pas de validation en laboratoire humide des variants, ne faisons pas de conseil génétique familial. Nous livrons des rapports d'interprétation du génome directement utilisables par les médecins.

Capacité Centrale · Pipeline 6 Étapes

Du VCF au rapport bilingue · Toutes vérifiées et livrées

Step 1Standardisation QC VCFbcftools norm + vérification QCVCF standardisé + JSON QC 已验证
Step 2Annotation Fonctionnelle des VariantsANNOVAR (dbNSFP42a)122 colonnes multianno.csv 已验证
Step 3Prédiction FM PathogénicitéAlphaGenome · Genos · Evo2 tri-modèle croisé200 variants · 14min · 3/3 modèles · 2/3 consensus 已验证
Step 4Auto-Classification ACMGClinVar VCF + dbNSFP 28 critères1526 LP / 5206 VUS (6732 variants) 已验证
Step 5Analyse Spécialisée (4 modules)PharmGKB + PRSice-2 + Mitochondrial + NCCN/ACMG652 drug-gene / PRS / 18 sites pathogènes / cancer+porteur 已验证
Step 6Génération Rapport (L1/L2/L3)Générateur v3 maison (1200 lignes)MD/HTML/PDF bilingue 已验证

Différenciation

Différences clés avec les rapports génomiques mono-modèle/mono-format

3M

Modèle de Fondation Génomique Tri-Modèle Croisé

AlphaGenome + Genos + Evo2 trois modèles de fondation votent ensemble, consensus 2/3 détermine la pathogénicité. Pas un seul modèle, mais validation croisée tri-modèle--couvrant différents principes de modélisation et contextes de population.

CN

Rapport en Langage Simple Chinois

Pas seulement une version professionnelle en anglais, mais aussi une version en langage simple en chinois pour les ordinary personnes--pas besoin de comprendre les algorithmes ou les abréviations médicales, vous dit directement ce que les résultats signifient.

Trois Formats · Deux Langues

Langage Simple Chinois

已验证

Plan d'action de santé facile à comprendre, sans connaissance algorithmique

MD / HTML / PDF

Professionnel Anglais

已验证

Rapport d'interprétation VCF pour professionnels médicaux

MD / HTML / PDF

Annexe Technique

已验证

Explication détaillée des métriques ACMG/PRS/pharmacogénomique

MD / PDF

Preuves de Classification ACMG

Analyse directe ClinVar VCF + évaluation automatique dbNSFP42a 28 critères, basée sur des preuves

1,526
Likely Pathogenic
PP3+PS2 double preuve
5,206
VUS
Preuves insuffisantes sous seuil
3,308
PP3 Preuve Pathogène
CADD≥25 / supports multiples
3,834
PS2 ClinVar Pathogène
Analyse VCF directe 100% correspondance
Échantillons :22:17097818:G:A IL17RA · Immunodeficiency 51 · ClinVar=Pathogenic · PP3(CADD=34)+PS2 -> Likely Pathogenic | 22:17182647:C:T ADA2 · Deficiency of adenosine deaminase 2 · ClinVar=Pathogenic · PP3+PS2 -> Likely Pathogenic

PharmGKB Pharmacogénomique

Analyse directe de PharmGKB relationships.tsv, 111 254 associations médicament-gène

652
Variants correspondants
9
Gènes impliqués
43
Médicaments associés
Échantillons :IL17RA -> TNF-alpha inhibitors (PD, ambiguous)  |  ADA2 -> associated drug-gene pairs (PD)

Résultats Inférence GPU Tri-Modèle

AutoDL RTX 4080 · 2026-07-02 · chr22 200 variants

3/3
Modèles vérifiés
Genos + AG + Evo2
14min
Temps inférence total
4.2s/variant avg
16.1GB
Pic VRAM
三模型常驻显存
2/3
Vote Consensus
多数同意方判定
Corrections clés :Evo2-1b->7b_base · vortex SDPA fallback · AlphaGenome attention bias dimension fix

Modèle de Fondation Génomique Tri-Modèle Croisé

AlphaGenome + Genos + Evo2 votent ensemble, consensus 2/3 détermine la pathogénicité

✓ GPU

AlphaGenome

DeepMind PyTorch port · 878MB权重

8192bp context · Expertise variants région régulatrice

Inférence GPU AutoDL vérifiée ✓

✓ GPU

Genos-1.2B

BGI · Mixtral MoE · 4.7GB权重

8K bp context · Optimisation population chinoise

Inférence GPU AutoDL vérifiée ✓

✓ GPU

Evo2-7b_base

Arc Institute · BF16 · 13GB权重

Modélisation DNA long contexte · SDPA fallback

Inférence GPU AutoDL vérifiée ✓

Benchmarks

Tous issus de productions réelles, non estimations

MétriqueValeurNote
Lots d'exécution15+MD/HTML/PDF bilingue tous formats
Couverture variants6,732Chromosome unique (chr22) rapport complet
Colonnes ANNOVAR122dbNSFP42a (48GB) + refGene + ensGene
Taux correspondance ClinVar100%6 732/6 732 variants tous correspondent aux enregistrements ClinVar
Classification ACMG1,526 LPLikely Pathogenic représente 22,7% (PP3+PS2 double preuve)
Correspondances PharmGKB6529 gènes × 43 médicaments entrées d'association
dbNSFP CADD3,387Dont 3 064 avec CADD≥25 signal pathogène fort
Modèles FM3/3Genos + AlphaGenome + Evo2-7b tous inférence GPU vérifiée (AutoDL RTX 4080)
Modules analyse spécialisée4/45b PRSice(BC 249/CAD 140K SNP); 5c mitochondrial 18 sites pathogènes(ClinVar chrM); 5d NCCN 15 gènes; 5e ACMG 11 gènes(11/11 détectés)
Formats rapport3MD + HTML + PDF
Langue中英双语Langage simple + Professionnel
Version rapportv3Générateur de rapport maison ~1200 lignes Python

Rapports d'Échantillon Disponibles

Rapport de santé génomique + annexe technique, version PDF bilingue. Toutes les 10 étapes du pipeline vérifiées et livrées.

Limites Honnêtes

Ce que nous pouvons et ne pouvons pas faire, clairement

Ce Que Nous Pouvez Faire

Interprétation VCF de bout en bout (QC->annotation->classification->rapport)
Prédiction croisée de pathogénicité FM tri-modèle (AlphaGenome + Genos + Evo2)
Auto-classification ACMG + correspondance ClinVar
Pharmacogénomique (PharmGKB 652 entrées) + PRS + mitochondrial + risque de cancer
Rapports triformats bilingues (langage simple + professionnel + annexe technique)

Ce Que Nous Ne Faisons Pas

Pas de diagnostic clinique (le rapport est pour référence, ne remplace pas l'avis médical)
Pas d'interprétation WGS génome entier (actuellement vérifié au chromosome unique chr22)
Pas de validation Sanger ou autre confirmation en laboratoire humide des variants
Pas de conseil génétique familial et analyse de pedigree
Pas de garantie que tous les VUS recevront une classification définitive

Glossaire

5 termes clés de l'interprétation du génome

Abrév.Nom CompletTraductionExplication
VCFVariant Call FormatFormat d'Appel de VariantFormat de fichier standard pour les variants génomiques, enregistrant les informations de mutation à chaque position
ACMGAmerican College of Medical GeneticsAmerican College of Medical GeneticsOrganisme faisant autorité établissant les normes de classification des variants génétiques, 5 niveaux : pathogène/probablement pathogène/VUS/probablement bénin/bénin
PRSPolygenic Risk ScoreScore de Risque PolygéniqueAgrège les petits effets de multiples loci pour évaluer le risque génétique global d'une maladie
FMFoundation ModelModèle de FondationGrand modèle AI pré-entraîné sur des données massives, adaptable à diverses tâches en aval
ClinVarClinVar DatabaseBase de Données ClinVarBase de données publique maintenue par le NCBI, enregistrant les relations entre variants génétiques et maladies