Typage HLA
✓ 已验证Validation croisée double-outil · Résolution 4 chiffres · Base du pipeline néoantigène
Le typage HLA est la première étape du pipeline néoantigène tumoral--sans typage HLA précis, toutes les prédictions de liaison MHC en aval sont sans fondement. DiVo Gen²AI utilise OptiType + Polysolver validation croisée double-algorithme, pas un seul outil. Cette page sert trois audiences : patients et public souhaitant comprendre HLA, hôpitaux et pharma cherchant des partenaires de calcul, investisseurs et pairs évaluant les capacités techniques.
Lisez « Qu'est-ce que le Typage HLA » ci-dessous--comprenez pourquoi c'est la première étape de l'immunothérapie.
Focus sur « Rôle de DiVo », « Pipeline 4 étapes », « Benchmarks »--validation croisée double-outil, pas simple exécution.
Focus sur « Différenciation », « Benchmarks », « Glossaire »--évaluez la barrière technique de ce service d'entrée.
Le typage HLA est l'étape d'entrée pour les services phares suivants
Qu'est-ce que le Typage HLA
HLA (Antigène Leucocytaire Humain) est le "badge d'identité" du système immunitaire--le type HLA de chacun est différent, déterminant comment votre système immunitaire distingue "soi" et "non-soi". En immunothérapie tumorale, le type HLA détermine quels fragments de mutation peuvent être "vus" par votre système immunitaire.
Le typage HLA détermine quels allèles HLA un patient porte. C'est la première étape du pipeline néoantigène--sans typage HLA précis, les prédictions de liaison MHC, structure pMHC et scoring d'immunogénicité en aval sont toutes impossibles. Un mauvais typage rend tout le pipeline vain.
DiVo n'utilise pas un seul outil et accepte le résultat, mais OptiType et Polysolver deux algorithmes indépendants pour validation croisée--deux algorithmes de principes différents donnent un jugement cohérent, améliorant la fiabilité d'ordres de grandeur.
HLA est le "modèle d'affichage" pour la présentation immunitaire. Différents modèles affichent différents fragments peptidiques--sans connaître le modèle, impossible de prédire quels peptides de mutation peuvent être présentés à la surface cellulaire pour la reconnaissance par les cellules T.
Un seul algorithme peut produire des faux positifs/négatifs dus à la qualité du séquençage ou aux biais d'alignement. Deux algorithmes indépendants se valident--les résultats cohérents sont fiables--c'est la différence fondamentale avec "exécuter une fois et livrer".
Le Rôle de DiVo Gen²AI
Le typage HLA est Step 1 du pipeline néoantigène 8 étapes de DiVo, et CT1 entrée du pipeline CAR-T 5 étapes. Nous fournissons le calcul de bout en bout des données de séquençage aux résultats de typage HLA finaux--pas juste un outil pour un rapport, mais validation croisée double-outil + détermination de cohérence, garantissant que les résultats peuvent servir directement d'entrée fiable pour les pipelines en aval.
Nous ne faisons pas de compatibilité HLA clinique (transplantation d'organes), ne faisons pas d'interprétation diagnostique clinique des résultats de typage. Nous livrons des résultats de typage HLA-I 4 chiffres intégrables dans le pipeline néoantigène.
Capacité Centrale · Pipeline 4 Étapes
Des données de séquençage aux résultats de typage HLA validés croisés
Contrôle Qualité Données Séquençage
✓ 已验证FastQC + Trimmomatic
Clean reads
Typage HLA-I OptiType
✓ 已验证OptiType 1.5.0
Résultats typage HLA-I 4 chiffres
Validation Croisée Polysolver
✓ 已验证Polysolver v4
Résultats typage HLA-I indépendants + rapport cohérence
Détermination Cohérence Double-Outil
✓ 已验证Logique de comparaison maison DiVo
Typage HLA final + annotation confiance
Différenciation
Différences clés avec le typage HLA mono-outil
Validation Croisée Double-Outil
OptiType + Polysolver exécutés indépendamment de principes différents, la validation croisée améliore la fiabilité. Le typage mono-outil peut avoir des faux positifs/négatifs ; consensus double-outil requis--dans le pipeline néoantigène, un mauvais typage HLA invalide tout le pipeline en aval.
Résolution 4 Chiffres
Pas un typage grossier à 2 chiffres (ex., A*02), mais précis à 4 chiffres (ex., A*02:01). La résolution 4 chiffres est une entrée requise pour la prédiction de liaison MHC--le typage à 2 chiffres ne peut pas distinguer les sous-types avec des affinités très différentes dans le même supertype.
Validation Croisée Double-Outil
Typage HLA-I (résolution 4 chiffres)
Typage HLA rapide basé RNA-seq/WES
A*24:02, B*39:01
Typage HLA-I (résolution 4 chiffres) · Validation croisée
Algorithme de typage HLA indépendant basé WES
A*01:01:01:01, B*07:02:01, C*01:02:01
Benchmarks
| Métrique | Valeur | Note |
|---|---|---|
| Résolution typage HLA-I | 4 chiffres | Niveau A*24:02, B*39:01 |
| Cohérence double-outil | Validé | Validation croisée OptiType + Polysolver |
| Méthodes de typage | 2 | Double algorithme RNA-seq/WES indépendant |
| Position pipeline | Step 1 | Entrée pipeline néoantigène 8 étapes |
Limites Honnêtes
Ce que nous pouvons et ne pouvons pas faire, clairement
Ce Que Nous Pouvez Faire
Ce Que Nous Ne Faisons Pas
Glossaire
5 termes clés du typage HLA
| Abrév. | Nom Complet | Traduction | Explication |
|---|---|---|---|
| HLA | Human Leukocyte Antigen | Antigène Leucocytaire Humain | Gènes MHC humains, déterminant comment le système immunitaire distingue "soi" et "non-soi" |
| MHC | Major Histocompatibility Complex | Complexe d'Histocompatibilité Majeur | Le "panneau d'affichage" sur la surface cellulaire, présentant les fragments protéiques intracellulaires aux cellules T |
| 4 位分辨率 | 4-digit resolution | Résolution 4 Chiffres | Ex., A*02:01, précis au niveau protéique des allèles, entrée requise pour la prédiction de liaison MHC |
| WES | Whole Exome Sequencing | Séquençage de l'Exome Entier | Séquençage des régions codantes (exons) du génome uniquement, rentable |
| RNA-seq | RNA Sequencing | Séquençage RNA | Séquençage des gènes exprimés dans les cellules, reflétant les niveaux de transcription réels des gènes HLA |
CAPACITY TRACE
能力回溯
这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
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