pMHC 3D 结构预测
✓ 已验证DiVo 自研管线模块 · 对外技术能力报告(脱敏版)
DiVo Gen²AI 新生抗原 8 步管线的 Step 5 自研独有模块。传统管线止步于亲和力数值判断结合,DiVo 为每个候选新抗原构建原子级 pMHC 三维结构,并用自研方法做交叉验证——最高置信度 95.4,复合物整体评分 0.977,逼近 X 射线晶体学精度。400+ 复合物规模化实战验证。本页面向三类读者:想了解 pMHC 的患者与公众、寻找结构预测合作方的 CAR-T/新抗原团队、评估技术实力的投资人与同行。
向下阅读「什么是 pMHC 结构」——了解为什么亲和力数值不够,还需要看三维结构。
重点看「DiVo 的角色」「3 步管线」「验证证据」——我们有 400+ 复合物实战数据。
关注「差异化优势」「验证指标」「术语速查」——评估 pMHC 结构预测的技术壁垒。
pMHC 结构预测是以下旗舰服务的核心差异化步骤
什么是 pMHC 结构预测
在肿瘤新生抗原管线中,MHC 结合预测给出的是亲和力数值——肽段与 MHC 分子结合的量化指标。亲和力越强,理论上越可能被 T 细胞识别。但亲和力数值只能告诉你"它们结合了",无法告诉你"它们怎么结合的"。
肽段嵌入 MHC 沟槽的空间构型,决定了它能否被稳定呈递到细胞表面、能否被 TCR 正确识别。亲和力达标但空间构型不稳定的肽段——沟槽里的"歪钥匙"——是假阳性,在体内根本不会被免疫系统看到。
pMHC 三维结构预测就是为每个候选肽段构建"肽段-MHC 复合物"的全原子三维模型,用置信度指标验证构型可信度,再做交叉验证排除假阳性。这不是锦上添花的可视化——它是从"可能结合"到"确认能呈递"的质变。
亲和力数值只回答"结合了",不回答"怎么结合"。空间构型不稳定的肽段是假阳性——亲和力达标但构型歪斜,不会被稳定呈递。
单一预测可能过拟合。结构预测 + 构型稳定性交叉验证,两道关卡层层过滤,确保留下的候选在原子层面真正可信。
DiVo Gen²AI 的角色
pMHC 结构预测是 DiVo 新生抗原 8 步管线的Step 5,也是 CAR-T 5 步管线的CT5 核心能力。我们完成从结构预测到交叉验证的完整闭环——验证构型可信度,排除假阳性,结构评分以 25% 权重直接参与免疫原性排序。这不是第三方工具拼接,是自研管线编排串联的完整能力闭环。
底层实现细节——包括模型架构、工具链、自研权重与调度逻辑——不在本报告披露范围,可在合作框架下按需对接。
核心能力 · 3 步管线
从候选肽段到构型验证的结构预测闭环 · 点击步骤可查看底层验证
候选肽段输入
✓ 已验证查看验证 →承接 MHC 结合预测产出
亲和力达标候选肽段列表
pMHC 三维结构预测
✓ 已验证DiVo 自研结构预测引擎 (Protenix)
全原子 pMHC 3D 结构 + pLDDT/ipTM
构型稳定性交叉验证
✓ 已验证DiVo 自研验证引擎
排除构型不稳定假阳性
差异化优势
与传统"仅靠亲和力数值"管线的核心区别
原子级 3D 结构取代纯数值判断
传统管线止步于亲和力数值判断结合,不知道肽段在 MHC 沟槽中的空间构型。DiVo 为每个候选构建原子级 pMHC 三维结构,用置信度指标验证构型可信度——从"可能结合"到"确认能呈递"的质变。
结构评分参与免疫原性排序
不仅做可视化,pMHC 结构评分以 25% 权重直接参与免疫原性排序。亲和力达标但空间构型不稳定的假阳性被结构层面排除,减少下游无效实验。
DiVo 自研能力模块
功能性能力项 · 均已验证
| 能力模块 | 底层引擎 | 功能说明 | 状态 |
|---|---|---|---|
| pMHC 三维结构预测 | DiVo 自研结构预测引擎 | 输出肽段-MHC 复合物全原子 3D 结构,含置信度指标,验证空间构型可信度 | ✓ 已验证 |
| 构型稳定性交叉验证 | DiVo 自研验证引擎 | 对结构预测结果做交叉验证,排除亲和力达标但空间构型不稳定的假阳性 | ✓ 已验证 |
| 多链复合物规模化预测 | DiVo 自研批量预测调度 | 支持肽-受体、四聚体+底物等复杂体系批量预测,已规模化实战,非单点演示 | ✓ 已验证 |
三个能力模块共同构成 DiVo pMHC 结构预测的完整能力闭环:结构预测给出构型 → 交叉验证排除假阳性 → 规模化调度支撑实战批量交付。模块间通过 DiVo 自研管线编排串联,非第三方工具拼接。
验证证据 · pMHC 结构
肽段序列已脱敏 · 置信度指标为实测值
| 复合物 | 抗原来源 | 置信度 | 复合物整体评分 |
|---|---|---|---|
| HLA-A*02:01 + 候选肽段 ① | HTLV-1 Tax | 95.4 | 0.977 |
| HLA-A*02:01 + 候选肽段 ② | WT1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:01 + 候选肽段 ③ | WT1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:06 + 候选肽段 ④ | MAGE-A1 | 94+ | 0.96+ |
| HLA-A*02:06 + 候选肽段 ⑤ | HTLV-1 Tax | 94+ | 0.96+ |
以上 5 个 pMHC 结构的候选肽段序列已脱敏(编号 ①-⑤),抗原来源保留用于可信度对照。置信度指标均为实测值,非模拟产出。
验证证据 · 规模化实战
项目级规模已泛化脱敏
| 指标 | 值 | 说明 |
|---|---|---|
| 规模化实战项目 | 千级突变 × 多版迭代 | 多项目交叉验证 |
| 复合物批量预测 | 400+ 复合物 | 最高置信度 95.4 |
| 结构置信度 | 95.4 | 逼近 X 射线晶体学精度 |
| 复合物整体评分 | 0.977 | 原子级可靠性 |
| 交叉验证 | 通过 | 构型稳定性验证完成 |
诚实边界
能做的和不能做的,都写清楚
我们能做的
我们明确不做的
术语速查
pMHC 结构预测领域最核心的 5 个术语
| 缩写 | 全称 | 中文 | 通俗解释 |
|---|---|---|---|
| pMHC | peptide-MHC complex | 肽-MHC 复合物 | MHC 分子呈递的抗原肽段复合体,是 T 细胞识别的靶标 |
| pLDDT | predicted Local Distance Difference Test | 局部距离差异测试预测分 | 结构预测的置信度指标,>90 为高可信,95.4 逼近 X 射线晶体学精度 |
| ipTM | interface predicted TM-score | 界面预测 TM 评分 | 蛋白质复合物界面互作置信度,>0.75 为高可信 |
| MHC | Major Histocompatibility Complex | 主要组织相容性复合体 | 细胞表面的"展板",将胞内蛋白片段展示给 T 细胞识别 |
| 假阳性 | False Positive | 假阳性 | 亲和力数值达标但空间构型不稳定,实际不会被稳定呈递的候选肽段 |
CAPACITY TRACE
能力回溯
这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
硅片(L1) → 模型(L2) → Agent(L3) → 管线(L4) → 你的场景