肿瘤新生抗原 mRNA 疫苗
✓ 已验证8 步全链路 · 从 VCF/BAM 到 mRNA 序列设计 · 科普 · 服务 · 技术
DiVo Gen²AI 大健康体系中最成熟、最具行业竞争力的管线。100% 覆盖肿瘤新抗原疫苗干实验全部环节。本页面向三类读者：想了解新抗原疫苗的患者与公众、寻找计算服务合作方的制药团队、评估技术实力的投资人与同行。
向下阅读「什么是新抗原疫苗」「5 步工作原理」「发展里程碑」——改变对免疫治疗的认知。
重点看「DiVo 的角色」「8 步管线」「已验证的技术能力」「样本报告」——我们有交付物可查。
关注「三大差异化」「验证指标」「TESLA 基准」「专业术语速查」——评估技术壁垒。
致患者和家属
我们肿瘤新生抗原干计算管线服务是与医疗机构协同配合的业务，不是直接面向个人用户与患者的服务，请通过患者所就诊的医疗机构的主治医生与我们联系与沟通相关技术服务事宜。我们不会越过主治医生向患者及家属提供任何关于患者的肿瘤症状及疗法的医疗意见。科学性的数据与报告，也请通过您的主治医生获取和征询解析。
手上有全基因组测序报告（VCF）？
如果您手头拥有您的全基因组测序报告文档 VCF，我们可以向您提供非医疗诊疗意见的纯科学解读与分析报告，具体请参考我们的通用服务——基因组解读报告。
什么是肿瘤新生抗原 mRNA 疫苗
每一个肿瘤细胞都携带着正常细胞没有的基因突变。其中一部分突变会产生新的蛋白质片段——新生抗原（Neoantigen）。它们是肿瘤细胞留在表面的"指纹"，免疫系统理论上可以据此识别并清除肿瘤，但现实中往往信号太弱、逃逸机制太多，免疫反应未能启动。
新生抗原 mRNA 疫苗的思路，是把患者肿瘤特有的突变片段编码进 mRNA，回输体内后让人体细胞自己翻译出这些抗原，主动激活特异性 T 细胞反应——相当于给免疫系统一份"通缉令"，让它去精准追杀携带这些指纹的肿瘤细胞。
这是一种完全个体化的治疗方案：每个患者的肿瘤突变图谱不同，对应的疫苗序列也不同。也正因如此，计算预测是整条管线的命门——一个肿瘤样本可能产生上千条候选肽段，不可能逐一做实验验证，必须靠算法精准筛出最可能引发免疫反应的少数几条。
只存在于肿瘤细胞、正常组织没有，理论上可被免疫系统精确识别而不误伤健康组织。
设计快、生产周期短、无需细胞培养，天然适配"一人一药"的个体化场景；序列即药物。
上千候选肽段无法逐个实验验证，算法筛选的精度直接决定疫苗能否真正激活 T 细胞。
mRNA 疫苗的 5 个步骤
从取瘤到免疫激活，一次完整的个体化疫苗流程
取瘤
获取患者的肿瘤组织样本和正常组织样本，进行全外显子测序（WES）
算靶
从测序数据中找出肿瘤特有的突变，通过 MHC 结合预测筛选出最可能激活 T 细胞的新抗原肽段
编 mRNA
将筛选出的新抗原肽段序列编码进 mRNA，优化密码子和 UTR 序列使其在人体内高效翻译
递送
将 mRNA 封装进脂质纳米颗粒（LNP）或树突状细胞（DC），注射到患者体内
免疫激活
人体细胞翻译 mRNA 产生新抗原蛋白，MHC 分子呈递给 T 细胞，启动特异性抗肿瘤免疫反应
整个流程约 4-8 周（主要是测序+计算+定制化 mRNA 合成的时间）。其中第 2 步"算靶"和第 3 步"编 mRNA"——从测序数据到 mRNA 序列设计——是 DiVo Gen²AI 计算服务的完整覆盖范围。
新生抗原 mRNA 疫苗发展里程碑
从 2017 年概念验证到 2025 年产业化加速
Sahin 团队（BioNTech）Nature 首次报道个体化新抗原 mRNA 疫苗临床结果，黑色素瘤患者产生新抗原特异性 T 细胞反应
概念验证
Wells 团队 Cell 发表 TESLA 基准，建立新抗原预测金标准（608 peptide-MHC）
AUROC 基准
Moderna mRNA-4157/V940 + Keytruda II 期显著延长无复发生存期，FDA 授予突破性疗法认定
联合免疫检查点
立康生命 LK101 注射液获 NMPA 临床批件，国内首个 AI+个性化新抗原 mRNA 疫苗
中国首款
BioNTech Autogene cevumeran III 期推进；Moderna 个体化新抗原疫苗管线扩展至多癌种
产业化加速
DiVo Gen²AI 的角色
在新抗原 mRNA 疫苗全流程中，我们负责"算靶 + 编 mRNA"的全部干实验环节
新抗原 mRNA 疫苗全流程中，"找到正确的靶"和"设计最优的 mRNA 序列"是最依赖计算预测的环节——不可能对每个候选肽段逐一做实验验证，必须靠算法精准筛选。
DiVo Gen²AI 覆盖这个环节的全部 8 步干实验：
- ▸HLA 分型——确定患者的 MHC 类型，分型错了后面全错
- ▸变异检测与肽段生成——从 VCF/BAM 提取肿瘤特异性突变和候选肽段
- ▸MHC 结合预测 + pMHC 结构验证——从 IC50 到原子级三维结构确认
- ▸5 维免疫原性评分——不是只看亲和力，5 个维度交叉筛选
- ▸mRNA 序列设计 + TCR 识别验证——从氨基酸序列到可交付的 mRNA
我们不生产疫苗实体，我们交付的是可以直接进入湿实验合成与临床申报的序列设计方案。
8 步管线全链路
100% 覆盖干实验全部环节 · 点击步骤可查看底层验证
HLA 分型
✓ 已验证查看验证 →OptiType + Polysolver 双工具交叉验证
4 位分辨率 HLA-I 分型结果
变异检测与注释
✓ 已验证GATK Mutect2 + VEP + ANNOVAR
体细胞变异清单 + 功能注释
肽段生成
✓ 已验证pVACseq + pVACfuse + ScanNeo2 + NeoGuider
候选新抗原肽段
MHC 结合预测
✓ 已验证MHCflurry(14,883 alleles) + MHCnuggets + IEDB API
IC50 最低 10.1 nM，22 条高亲和力候选
pMHC 3D 结构预测
✓ 已验证查看验证 →DiVoFold5/Protenix
原子级 pMHC 结构，pLDDT=95.4, ipTM=0.977
5 维免疫原性评分
✓ 已验证MHC亲和力30%+呈递20%+加工10%+已知免疫原性15%+结构评分25%
45 条候选 Tier 分级，17 Tier-1
mRNA 序列设计
✓ 已验证查看验证 →GEMORNA + RNALens自研微调 + DNAChisel + ViennaRNA
CAI 0.7→0.95, MRL Spearman=0.92
TCR 识别验证
✓ 已验证DeepTCR(Recon Acc=0.972) + ProTCR
TCR 识别可行性评估
三大差异化优势
传统管线不具备的能力
差异化 1
pMHC 3D 结构验证
传统管线仅靠 IC50 数值判断结合。DiVo 为每个候选构建原子级 pMHC 三维结构，pLDDT/ipTM 验证空间构型可信度。400+ 复合物规模化验证。
差异化 2
5 维免疫原性评分
传统管线仅用 MHC 亲和力筛选。DiVo 增加 5 个评分维度——亲和力 30%+呈递 20%+加工 10%+已知免疫原性 15%+结构评分 25%，筛选精度更高。
差异化 3
RNALens 自研微调
mRNA 序列设计的核糖体装载效率预测——Spearman=0.92, R²=0.87——基于 DNABERT-Z 117M 三阶段微调。不是调用第三方 API，是 56 万行自研代码的一部分。
可验证的工程底座
| 指标 | 值 | 说明 |
|---|---|---|
| TESLA 基准 AUROC | 0.698 | Wells Cell 2020, 608 peptide-MHC |
| MHC-I allele 覆盖 | 65 | IC50 实测最低 10.1 nM |
| MHC-II allele 覆盖 | 25 | 13 DR + 5 DP + 7 DQ |
| pMHC 结构 pLDDT | 95.4 | 逼近 X 射线晶体学精度 |
| pMHC ipTM | 0.977 | 复合物整体置信度 |
| RNALens MRL Spearman | 0.92 | R²=0.87, 自研微调 |
| mRNA CAI 提升 | 0.7→0.95 | 密码子适应指数优化 |
| 规模化实战 | 400+ | 复合物批量预测验证 |
| 候选 Tier-1 数量 | 17 | 45 条候选中最高等级 |
Top 5 Tier-1 候选新抗原
实际验证数据，不是模拟值
| 肽段 | HLA | 抗原来源 | IC50 (nM) | 评分 | Tier |
|---|---|---|---|---|---|
| LLFGYPVYV | HLA-A*02:01 | HTLV-1 Tax | 10.1 | 100 | Tier-1 |
| KVAELVHFL | HLA-A*02:01 | MAGE-A1 | 14.4 | 100 | Tier-1 |
| RMFPNAPYL | HLA-A*02:01 | WT1 | 14.3 | 100 | Tier-1 |
| FLWGPRALV | HLA-A*02:01 | WT1 | 13.6 | 93 | Tier-1 |
| IMDQVPFSV | HLA-A*02:01 | NY-ESO-1 | 15.9 | 93 | Tier-1 |
已验证的技术能力
每一个底层管线都有独立验证数据 + 样本报告
HLA 分型（双工具交叉验证）
✓ 已验证· 有样本报告OptiType + Polysolver 双工具，4 位分辨率 HLA-I 分型。新抗原管线的第一步——分型错了，后面全错。
pMHC 3D 结构预测 + 对接验证
✓ 已验证· 有样本报告Protenix + Protenix-Dock，pLDDT=95.4, ipTM=0.977，400+ 复合物验证。从 IC50 数值到原子级三维结构。
mRNA 序列优化（RNALens）
✓ 已验证· 有样本报告GEMORNA + RNALens 自研微调，Spearman=0.92, CAI 0.7→0.95。56 万行自研代码，不是调用第三方 API。
基因组解读报告
✓ 已验证· 有样本报告10 步全链路，3 基因组 FM 交叉验证，HCC1395 WGS 验证通过。新抗原管线的测序数据上游。
CAR-T 细胞治疗计算
✓ 已验证新抗原管线的下游延展——靶点推荐 + Binder 从头设计 + 结构验证 + mRNA 优化，5 步管线。
诚实边界
能做的和不能做的，都写清楚
我们能做的
我们明确不做的
样本报告可查看
完整的 8 步管线模拟报告，包含 HLA 分型、MHC 结合预测、pMHC 结构、免疫原性评分、mRNA 序列设计全流程输出。14 页 PDF + MD 双语版本。
行业市场费用参考
公开信息整理 · 非 DiVo 收费标准 · 仅供参考
边界说明：以下为肿瘤新生抗原 mRNA 疫苗完整疗程的市场公开参考价，涵盖肿瘤测序、新抗原筛选、mRNA 合成、递送系统、个性化生产与医院端的全部费用。DiVo Gen²AI 承接的是其中的干实验计算环节（即本页 8 步管线），并非疫苗实体的生产与销售方。
费用构成与影响因素
以上为公开报道的参考数据，实际费用需咨询具体医院/公司并评估患者适应症、安全性与疗效。这类治疗多为自费，建议结合医生意见、临床试验入组（可能降低费用）或经济能力综合考虑。
专业术语速查
10 个新抗原 mRNA 疫苗领域最常遇到的专业术语
| 缩写 | 全称 | 中文 | 通俗解释 |
|---|---|---|---|
| Neoantigen | Neoantigen | 新生抗原 | 肿瘤特异性突变产生的抗原肽段，正常组织不表达，是个体化疫苗的靶标 |
| MHC | Major Histocompatibility Complex | 主要组织相容性复合体 | 细胞表面的"展板"，将胞内蛋白片段展示给 T 细胞识别 |
| HLA | Human Leukocyte Antigen | 人类白细胞抗原 | MHC 在人体中的名称，决定了哪些肽段能被呈递给 T 细胞 |
| IC50 | Half Maximal Inhibitory Concentration | 半数抑制浓度 | MHC 与肽段结合亲和力的数值指标，越低越强（<50 nM 为强结合） |
| pMHC | peptide-MHC complex | 肽-MHC 复合物 | MHC 分子呈递的抗原肽段复合体，是 T 细胞识别的靶标 |
| pLDDT | predicted Local Distance Difference Test | 局部距离差异测试 | 蛋白质结构预测置信度，>90 为高置信度，>70 为可用 |
| ipTM | interface predicted TM-score | 界面预测 TM 评分 | 蛋白质复合物界面互作置信度，>0.75 为高可信 |
| CAI | Codon Adaptation Index | 密码子适应指数 | mRNA 序列翻译效率指标，越接近 1 越高效 |
| MRL | Mean Ribosome Load | 平均核糖体装载量 | mRNA 翻译效率的直接度量，越高蛋白表达量越大 |
| LNP | Lipid Nanoparticle | 脂质纳米颗粒 | mRNA 递送载体，保护 mRNA 进入人体细胞后释放并翻译 |
CAPACITY TRACE
能力回溯
这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
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