Tipificación HLA
✓ 已验证Validación cruzada de doble herramienta · Resolución de 4 dígitos · Base del pipeline de neoantígenos
La tipificación HLA es el primer paso del pipeline de neoantígenos tumorales--sin una tipificación HLA precisa, todas las predicciones de unión MHC posteriores se construyen sobre arena. DiVo Gen²AI utiliza OptiType + Polysolver con validación cruzada de doble algoritmo, no una sola ejecución de herramienta. Esta página sirve a tres audiencias: pacientes y público que desean comprender HLA, hospitales y farmacéuticas que buscan socios de servicios computacionales, e inversores y colegas que evalúan capacidades técnicas.
Lea "Qué es la tipificación HLA" a continuación--comprenda por qué es el primer paso de la inmunoterapia.
Enfóquese en "El rol de DiVo", "Pipeline de 4 pasos", "Benchmarks"--validación cruzada de doble herramienta, no una sola ejecución.
Enfóquese en "Diferenciación", "Benchmarks", "Glosario"--evalúe la barrera técnica de este servicio de entrada.
La tipificación HLA es el paso de entrada para los siguientes servicios insignia
Qué es la tipificación HLA
HLA (Antígeno Leucocitario Humano) es la "etiqueta de identidad" del sistema inmunológico--el tipo HLA de cada persona es diferente, determinando cómo su sistema inmunológico distingue "lo propio" de "los invasores". En la inmunoterapia tumoral, el tipo HLA determina qué fragmentos de mutación pueden ser "vistos" por su sistema inmunológico.
La tipificación HLA determina qué alelos HLA porta un paciente. Este es el primer paso del pipeline de neoantígenos--sin una tipificación HLA precisa, la predicción de unión MHC, la predicción de estructura pMHC y la puntuación de inmunogenicidad posteriores son imposibles. Una tipificación incorrecta significa que todo el pipeline se ejecuta en vano.
DiVo no utiliza una sola herramienta y acepta el resultado, sino que usa OptiType y Polysolver, dos algoritmos independientes para validación cruzada--dos algoritmos de diferentes principios dan un juicio consistente, mejorando la fiabilidad en órdenes de magnitud.
HLA es el "modelo de exhibición" para la presentación inmunológica. Diferentes modelos exhiben diferentes fragmentos peptídicos--sin conocer el modelo, no se puede predecir qué péptidos de mutación pueden ser presentados en la superficie celular para el reconocimiento por células T.
Un solo algoritmo puede producir falsos positivos/negativos debido a la calidad de secuenciación o sesgo de alineación. Dos algoritmos independientes se validan cruzadamente--los resultados consistentes son confiables--esta es la diferencia fundamental con "ejecutar una vez y entregar".
El rol de DiVo Gen²AI
La tipificación HLA es el Paso 1 del pipeline de neoantígenos de 8 pasos de DiVo, y la entrada CT1 del pipeline CAR-T de 5 pasos. Proporcionamos computación de extremo a extremo desde datos de secuenciación hasta resultados finales de tipificación HLA--no solo ejecutando una herramienta para un informe, sino validación cruzada de doble herramienta + determinación de consistencia, asegurando que los resultados puedan servir directamente como entrada confiable para los pipelines posteriores.
No hacemos compatibilidad HLA clínica (para trasplante de órganos), no hacemos interpretación diagnóstica clínica de los resultados de tipificación. Entregamos resultados de tipificación HLA-I de 4 dígitos que pueden integrarse en el pipeline de neoantígenos.
Capacidad central · Pipeline de 4 pasos
Desde datos de secuenciación hasta resultados de tipificación HLA validados cruzadamente
Control de calidad de datos de secuenciación
✓ 已验证FastQC + Trimmomatic
Lecturas limpias
Tipificación HLA-I con OptiType
✓ 已验证OptiType 1.5.0
Resultados de tipificación HLA-I de 4 dígitos
Validación cruzada con Polysolver
✓ 已验证Polysolver v4
Resultados independientes de tipificación HLA-I + informe de consistencia
Determinación de consistencia de doble herramienta
✓ 已验证Lógica de comparación interna de DiVo
Tipificación HLA final + anotación de confianza
Diferenciación
Diferencias clave con la tipificación HLA de herramienta única
Validación cruzada de doble herramienta
OptiType + Polysolver se ejecutan independientemente desde diferentes principios, la validación cruzada mejora la fiabilidad. La tipificación de herramienta única puede tener falsos positivos/negativos; se requiere consenso de doble herramienta--en el pipeline de neoantígenos, una tipificación HLA incorrecta invalida todo el pipeline posterior.
Resolución de 4 dígitos
No tipificación gruesa de 2 dígitos (ej., A*02), sino precisa a 4 dígitos (ej., A*02:01). La resolución de 4 dígitos es una entrada requerida para la predicción de unión MHC--la tipificación de 2 dígitos no puede distinguir subtipos con afinidades muy diferentes dentro del mismo supertipo.
Validación cruzada de doble herramienta
Tipificación HLA-I (resolución de 4 dígitos)
Tipificación HLA rápida basada en RNA-seq/WES
A*24:02, B*39:01
Tipificación HLA-I (resolución de 4 dígitos) · Validación cruzada
Algoritmo independiente de tipificación HLA basado en WES
A*01:01:01:01, B*07:02:01, C*01:02:01
Benchmarks
| Métrica | Valor | Nota |
|---|---|---|
| Resolución de tipificación HLA-I | 4 dígitos | Nivel A*24:02, B*39:01 |
| Consistencia de doble herramienta | Aprobada | Validación cruzada OptiType + Polysolver |
| Métodos de tipificación | 2 | Doble algoritmo RNA-seq/WES independientemente |
| Posición en pipeline | Paso 1 | Entrada del pipeline de neoantígenos de 8 pasos |
Límites honestos
Lo que podemos y no podemos hacer, claramente establecido
Lo que podemos hacer
Lo que no hacemos
Glosario
5 términos clave en tipificación HLA
| Abrev. | Nombre completo | Traducción | Explicación |
|---|---|---|---|
| HLA | Human Leukocyte Antigen | Antígeno Leucocitario Humano | Genes MHC humanos, determinando cómo el sistema inmunológico distingue "lo propio" de "lo ajeno" |
| MHC | Major Histocompatibility Complex | Complejo Principal de Histocompatibilidad | El "tablero de exhibición" en la superficie celular, presentando fragmentos proteicos intracelulares a las células T |
| 4 位分辨率 | 4-digit resolution | Resolución de 4 dígitos | Ej., A*02:01, preciso al nivel proteico del alelo, entrada requerida para predicción de unión MHC |
| WES | Whole Exome Sequencing | Secuenciación del Exoma Completo | Secuenciación solo de las regiones codificantes (exones) del genoma, rentable |
| RNA-seq | RNA Sequencing | Secuenciación de RNA | Secuenciación de genes expresados en las células, reflejando los niveles reales de transcripción de genes HLA |
CAPACITY TRACE
能力回溯
这项服务由哪些能力支撑——从硅片到你的场景
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