HLA

Tipificación HLA

Validación cruzada de doble herramienta · resolución de 4 dígitos

OptiType + Polysolver doble herramienta operando independientemente desde diferentes principios, tipificación HLA-I de 4 dígitos validada cruzadamente. Servicio de entrada para el Paso 1 del pipeline de neoantígenos y CT1 del pipeline CAR-T--tipificación HLA incorrecta invalida todo el pipeline downstream.

3-5 días20K-50K/muestraCobertura de Capacidad 90%

Flujo del Pipeline

Bucle de cómputo en seco de extremo a extremo

QC de Datos de Secuenciación

FastQC + Trimmomatic control de calidad y limpieza

Tipificación HLA-I OptiType

OptiType 1.5.0 tipificación rápida HLA-I basada en RNA-seq/WES (resolución de 4 dígitos)

Validación Cruzada Polysolver

Polysolver v4 algoritmo independiente de tipificación HLA-I basado en WES

Determinación de Consenso de Doble Herramienta

Lógica de comparación propietaria de DiVo, tipificación HLA final determinada solo cuando ambas herramientas coinciden + anotación de confianza

Herramientas Principales

OptiType 1.5.0Polysolver v4FastQCTrimmomatic

Ventajas Clave

Validación Cruzada de Doble Herramienta

OptiType + Polysolver operan independientemente desde diferentes principios, falsos positivos/negativos de herramienta única eliminados por validación cruzada

Resolución de 4 Dígitos

Precisa a nivel A*02:01, entrada necesaria para predicción de unión MHC--tipificación de 2 dígitos no puede distinguir diferencias de afinidad de subtipos