드라이 컴퓨팅 개요로 돌아가기
CT
CAR-T 세포 치료 계산
듀얼 채널 타겟 발견 + de novo Binder 설계 + pMHC 3D 구조 검증
5단계 드라이 컴퓨팅 파이프라인--HLA 타이핑 + 변이 검출부터 CAR Binder de novo 설계 + 구조 검증까지. 기존 scFv 한계 돌파, AI로 단백질 Binder를 제로부터 설계, 2024 Nature BME에서 이 루트 검증 완료.
3-5주20-80만/프로젝트능력 커버리지 85%
파이프라인 플로우
엔드투엔드 드라이 컴퓨팅 루프
1
CT1 HLA 타이핑 + 변이 검출
OptiType + Polysolver 듀얼 툴 4자리 HLA-I 타이핑 + GATK Mutect2 체세포 변이 + VEP/ANNOVAR 주석
2
CT2 신생항원 스크리닝 + 표면항원 마이닝
MHCflurry(14,883 alleles) 신생항원 스크리닝 + pVACseq + Salmon/DESeq2 차이 발현 마이닝으로 종양 특이적 막 단백질 발굴
3
CT3 면역원성 전차원 평가
5차원 평점(친화력30%+제시20%+가공10%+면역원성15%+구조25%) + DeepTCR 인식 실현성
4
CT4 CAR Binder de novo 설계
PXDesign + RFdiffusion + ProteinMPNN de novo 단백질 Binder 후보 서열 설계
5
CT5 구조 검증 + 평점
Protenix(pLDDT/ipTM) + Protenix-Dock + PXMeter 원자 수준 복합체 구조 + 도킹 점수
핵심 도구
OptiTypePolysolverGATK Mutect2VEPANNOVARMHCflurrypVACseqSalmonDESeq2RFdiffusionProteinMPNNPXDesignProtenixProtenix-DockPXMeter
핵심 우위
듀얼 채널 타겟 발견
VCF 신생항원 스크리닝 + RNA-seq 차이 발현 듀얼 채널 교차 검증, 단일 채널 한계 돌파
de novo Binder 설계
RFdiffusion + ProteinMPNN de novo 단백질 Binder 설계, scFv 친화력·안정성 병목 돌파
pMHC 3D 구조 검증
Protenix 원자 수준 구조 검증 (pLDDT=95.4, ipTM=0.977), 위양성 감소
능력 커버리지
85%CROSS-LAYER
이 서비스가 의존하는 하위 능력
USER SCENE
이 기술이 환자에게 어떻게 기여하는가
B2B2C: 병원/의사를 통해 이 파이프라인은 이러한 C단 시나리오에 도달